Στο Π.Μ.Σ. για την απόκτηση Μ.Δ.Ε. γίνονται δεκτοί, ύστερα από επιλογή, οι εξής κατηγορίες πτυχιούχων: (α) Πτυχιούχοι Τμημάτων Θεολογικών Σχολών της ημεδαπής ή ομοταγών αναγνωρισμένων Θεολογικών Σχολών της αλλοδαπής, (β) Σε ειδικές εξαιρετικές περιπτώσεις και ύστερα από αιτιολογημένη εισήγηση της πενταμελούς εξεταστικής επιτροπής (αποτελείται από 5 μέλη της Επιτροπής Μεταπτυχιακών Προγραμμάτων του Τμήματος, ένα από κάθε τομέα, και ορίζεται με απόφαση της Γ.Σ.Ε.Σ) γίνονται δεκτές υποψηφιότητες πτυχιούχων άλλων Σχολών ή Τμημάτων της ημεδαπής ή ομοταγών αναγνωρισμένων ιδρυμάτων της αλλοδαπής, με την προϋπόθεση ότι το γνωστικό αντικείμενο της σχεδιαζόμενης μελέτης: (i) βρίσκεται στη συνέχεια των σπουδών τους και (ii) θεραπεύεται από το Τμήμα Θεολογίας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης.